大豆（Glycine max）是重要的食品和饲料，富含油脂和蛋白质。它可以作为生物柴油的原料，这吸引了美国能源部联合基因组研究所(JGI)的注意。根据2007年美国调查数据显示，大豆估计可占据80%的生物柴油产量。

12月8日在墨西哥召开的国际豆类基因组学和遗传学会议上，JGI科学家和合作机构公布了大豆完整基因组草图，测序工作用时3年。

很多植物学家一直对能否用由Craig Venter开发的“鸟枪法”（shotgun）对大豆测序表示怀疑。但研究小组领导人之一、美国密苏里大学Gary Stacey表示，“工作进行得并不费力。”研究小组将序列和先前已知的大豆基因对照，另一名项目领导人、JGI的Dan Rokhsar表示，至少98%的基因包括在测得的基因组中。

生物燃料设计人员和农场主都可以因此获益。Stacey表示：“现在我们能够识别所有参与结籽期油脂合成的基因，这有助于增加油产量。”Rokhsar强调说，这一成果还可提高生产效率。种植大豆的农场主则有望使用基因组信息来培育高产作物，或是含高蛋白的大豆品种。

全世界种植大豆的土地有9500万公顷，虽然发源于亚洲，但现在种植地区主要集中在美洲。有数据显示，在过去30年中大豆产量增长了超过200%。2005年水稻基因组测序完成，现在大豆基因组测序工作结束，接下来科学家还将进行小麦和玉米的基因组测序工作。