生态系统是具开放性、非线性发展规律的能值网络系统，其自组织动态规律的理论研究由来已久，并在功能与结构两方面分别取得长足发展，但实证研究匮乏。生态系统自组织功能与结构经典假说有待检验，效率规律有待揭示。

中科院华南植物园植被景观生态学研究组陆宏芳研究员等，以鹤山丘陵植被恢复实验站针叶林、桉林、相思林和乡土混交林为研究对象，综合运用Emergy和Eco-exergy理论方法，分析评价了4个南亚热带森林恢复模式建立20年之后的系统自组织状态与效率。结果表明，初始状态的不同确实会对系统自组织状态与效率带来长期影响。两个外来种人工林在生物量和土壤有机质积累方面表现较好，而两个乡土种人工林在外部负熵资源的摄取能力方面表现突出。能值转换率指标同时考虑了流入与库的变化，可用于评价系统的自组织效率。南亚热带森林演替早期植被基于Eco-exergy的植被总体有序程度的主要贡献来自于乔木层，而基于Specific Eco-exergy的单位生物量植被有序程度主要贡献来自于灌草层。物种遗传信息量C值悖论确实存在，并会在一定程度上影响以其为基础的Eco-exergy评价结果。Emergy与Eco-exergy两种理论方法的综合使用，有利于实现生态系统自组织结构、功能与效率的综合评价。